Коротко
Да. Добавьте сколько угодно мест назначения, у каждого свой провайдер, бакет, ключи, публичный URL и шаблон пути, и переключайтесь между ними в панели строки меню.
Место назначения, выбранное в панели, используется по умолчанию: для перетаскивания, вставки и глобального сочетания клавиш. Типичная схема: один бакет для скриншотов и другой для файлов клиентов.
В библиотеке историю загрузок можно фильтровать по месту назначения, и каждая запись помнит, куда была загружена, поэтому удаление файла из бакета всегда затрагивает нужный бакет.